¿Cómo se puede decir que una de las marcas de la Iglesia es la unidad cuando en un momento hubo tres papas?

Tus hechos están equivocados. Nunca hubo tres Papas a la vez, y tampoco dos a la vez. Pero hubo momentos en que había dos aspirantes al cargo, y una vez, en el siglo XIV, hubo tres aspirantes.

La pregunta entonces es: ¿Quién fue el verdadero Papa? Nadie en ese momento pensó que pudiera haber más de uno.

Consideremos una analogía de la política estadounidense reciente. En una elección reñida, uno podría preguntarse: ¿Quién es el verdadero presidente? Incluso si la respuesta no estuviera clara por un tiempo, todos sabríamos que sólo puede haber un presidente a la vez, incluso si más de uno se proclamara vencedor.

Por cierto, hoy en día el colegio cardenalicio permanece encerrado hasta que se resuelvan las disputas electorales. Eso no es mala idea.