¿Puedo hacer que se diga una misa por el descanso del alma de un protestante? ¿Qué pasa con mis oraciones si ya está en el cielo o en el infierno?

Puedes, y debes, celebrar una misa para tu amigo protestante o para cualquier persona.

Si aquel por quien oramos está en el cielo, no necesita nuestras oraciones. Si está en el infierno, ninguna oración podrá beneficiarle. Pero como la Iglesia no pretende saber si un alma en particular está condenada, no debemos juzgar sino orar. El resto depende de Dios. Sólo Dios juzga el corazón (cf. 1 Sm 16).